Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN2P51788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms