Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR5P51681 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR5P51681 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR5P51681 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR5P51681 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR5P51681 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR5P51681 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR5P51681 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR5P51681 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR5P51681 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR5P51681 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR5P51681 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR5P51681 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR5P51681 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR5P51681 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms