Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPT1P50897 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPT1P50897 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPT1P50897 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPT1P50897 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPT1P50897 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPT1P50897 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPT1P50897 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPT1P50897 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPT1P50897 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPT1P50897 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms