Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNTC1P50748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNTC1P50748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms