Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS41P49754 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS41P49754 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS41P49754 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS41P49754 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS41P49754 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS41P49754 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS41P49754 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS41P49754 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS41P49754 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS41P49754 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS41P49754 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS41P49754 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
VPS41P49754 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS41P49754 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS41P49754 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS41P49754 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS41P49754 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS41P49754 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS41P49754 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS41P49754 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS41P49754 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS41P49754 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms