Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMUP48645 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMUP48645 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMUP48645 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMUP48645 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMUP48645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMUP48645 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NMUP48645 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMUP48645 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms