Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNC1P48547 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC1P48547 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC1P48547 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms