Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCLMP48507 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCLMP48507 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLMP48507 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLMP48507 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCLMP48507 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLMP48507 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLMP48507 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLMP48507 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCLMP48507 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLMP48507 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLMP48507 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLMP48507 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCLMP48507 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLMP48507 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLMP48507 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLMP48507 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLMP48507 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCLMP48507 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCLMP48507 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLMP48507 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLMP48507 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLMP48507 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLMP48507 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLMP48507 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLMP48507 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLMP48507 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLMP48507 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCLMP48507 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCLMP48507 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLMP48507 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLMP48507 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLMP48507 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLMP48507 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLMP48507 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms