Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABIFP47224 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABIFP47224 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABIFP47224 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABIFP47224 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RABIFP47224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABIFP47224 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RABIFP47224 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABIFP47224 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABIFP47224 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABIFP47224 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABIFP47224 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABIFP47224 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABIFP47224 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABIFP47224 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABIFP47224 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABIFP47224 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABIFP47224 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABIFP47224 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABIFP47224 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABIFP47224 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABIFP47224 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABIFP47224 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABIFP47224 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABIFP47224 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RABIFP47224 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABIFP47224 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms