Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GALR1P47211 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GALR1P47211 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GALR1P47211 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GALR1P47211 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GALR1P47211 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GALR1P47211 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms