Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR4P46093 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR4P46093 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR4P46093 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR4P46093 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR4P46093 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR4P46093 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR4P46093 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR4P46093 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR4P46093 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR4P46093 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR4P46093 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPR4P46093 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPR4P46093 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPR4P46093 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPR4P46093 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPR4P46093 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPR4P46093 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms