Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA4P43681 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms