Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD52P43351 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD52P43351 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD52P43351 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD52P43351 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD52P43351 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD52P43351 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD52P43351 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD52P43351 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD52P43351 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD52P43351 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD52P43351 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD52P43351 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD52P43351 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD52P43351 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD52P43351 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD52P43351 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD52P43351 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD52P43351 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD52P43351 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD52P43351 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms