Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPD2P43304 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPD2P43304 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPD2P43304 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPD2P43304 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPD2P43304 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPD2P43304 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPD2P43304 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPD2P43304 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPD2P43304 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPD2P43304 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPD2P43304 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPD2P43304 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPD2P43304 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPD2P43304 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPD2P43304 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPD2P43304 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPD2P43304 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPD2P43304 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPD2P43304 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPD2P43304 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPD2P43304 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPD2P43304 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPD2P43304 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPD2P43304 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPD2P43304 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPD2P43304 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms