Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 RGS5-213ENST00000427213 616 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-207ENST00000530241 576 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-203ENST00000428971 580 ntTSL 55.5□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 PUM3-204ENST00000490444 340 ntTSL 52.65□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 312.64□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.59□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.85□□□□□ -1.478e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 ELL2-208ENST00000635633 467 ntTSL 36.48□□□□□ -1.374e-10■■■■■ 27.7
MATR3P43243 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.659e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 DENND5A-205ENST00000526707 2861 ntTSL 221■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 DENND5A-206ENST00000527700 3593 ntTSL 28.84□□□□□ -0.999e-7■■■■■ 27.7
MATR3P43243 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.012e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 27.6
MATR3P43243 GUSBP11-205ENST00000452737 1662 ntTSL 1 (best)23.83■■□□□ 1.46e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 GUSBP11-201ENST00000422506 2055 ntTSL 223.69■■□□□ 1.386e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 AP000347.1-207ENST00000432595 601 ntTSL 321.44■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SPIDR-220ENST00000522900 692 ntTSL 320.42■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 27.6
MATR3P43243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 27.6
MATR3P43243 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.75■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 27.6
MATR3P43243 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 RNGTT-204ENST00000627296 2017 ntTSL 216.38■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 215.53■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-201ENST00000339174 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-207ENST00000555762 5573 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-206ENST00000471252 793 ntTSL 212.33□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 PTPRM-205ENST00000577827 4640 ntTSL 211.77□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 211.21□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-207ENST00000476359 5460 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-208ENST00000481089 540 ntTSL 210.14□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-204ENST00000382872 6617 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 NLGN4Y-202ENST00000355905 5167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 SPIDR-218ENST00000522222 585 ntTSL 47.38□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 27.6
MATR3P43243 FER-205ENST00000505323 806 ntTSL 36.65□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 DCBLD2-203ENST00000449482 554 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.46e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 AC016205.1-202ENST00000591469 1639 ntTSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 PTPRM-204ENST00000577468 701 ntTSL 33.41□□□□□ -1.866e-7■■■■■ 27.6
MATR3P43243 LCLAT1-211ENST00000491680 1610 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 LCLAT1-209ENST00000478015 1862 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 27.5
MATR3P43243 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 27.5
MATR3P43243 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 27.5
MATR3P43243 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 27.5
MATR3P43243 MIER1-210ENST00000479067 745 ntTSL 54.69□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 420.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-206ENST00000544801 875 ntTSL 517.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 417.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-203ENST00000536670 449 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 49.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 AP003108.2-205ENST00000538594 569 ntTSL 49.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 SORBS2-249ENST00000476878 595 ntTSL 37.86□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 27.5
MATR3P43243 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 HSD17B7P2-201ENST00000471365 1033 ntBASIC10.29□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-217ENST00000514419 863 ntTSL 321.03■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-204ENST00000369635 2578 ntTSL 516.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-214ENST00000509338 505 ntTSL 315.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-219ENST00000515216 3288 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-213ENST00000508980 3615 ntTSL 25.7□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 SNX14-216ENST00000513869 530 ntTSL 42.6□□□□□ -1.993e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PPM1H-203ENST00000548414 522 ntTSL 322.86■■□□□ 1.258e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 27.4
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