Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSKP43235 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSKP43235 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSKP43235 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSKP43235 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSKP43235 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSKP43235 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSKP43235 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSKP43235 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSKP43235 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSKP43235 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSKP43235 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSKP43235 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSKP43235 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSKP43235 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms