Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CBP42338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms