Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELK3P41970 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELK3P41970 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELK3P41970 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELK3P41970 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ELK3P41970 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELK3P41970 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ELK3P41970 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ELK3P41970 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELK3P41970 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELK3P41970 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELK3P41970 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELK3P41970 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELK3P41970 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELK3P41970 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELK3P41970 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELK3P41970 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELK3P41970 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELK3P41970 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELK3P41970 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms