Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
KDM5CP41229 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5CP41229 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5CP41229 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5CP41229 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms