Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR1P36897 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR1P36897 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR1P36897 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms