Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM1P36871 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM1P36871 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM1P36871 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGM1P36871 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGM1P36871 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGM1P36871 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGM1P36871 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGM1P36871 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGM1P36871 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM1P36871 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM1P36871 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM1P36871 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGM1P36871 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGM1P36871 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGM1P36871 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGM1P36871 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGM1P36871 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGM1P36871 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM1P36871 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM1P36871 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM1P36871 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM1P36871 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGM1P36871 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms