Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LSP1P33241 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSP1P33241 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSP1P33241 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSP1P33241 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSP1P33241 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LSP1P33241 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSP1P33241 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSP1P33241 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSP1P33241 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSP1P33241 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSP1P33241 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSP1P33241 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSP1P33241 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms