Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP1P32455 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP1P32455 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP1P32455 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP1P32455 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP1P32455 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP1P32455 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP1P32455 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP1P32455 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP1P32455 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP1P32455 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP1P32455 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP1P32455 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP1P32455 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP1P32455 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP1P32455 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP1P32455 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP1P32455 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP1P32455 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP1P32455 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP1P32455 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP1P32455 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP1P32455 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP1P32455 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP1P32455 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms