Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA3P32297 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms