Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC13P31276 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC13P31276 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms