Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA7P31268 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms