Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPP30301 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPP30301 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIPP30301 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIPP30301 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIPP30301 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MIPP30301 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIPP30301 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIPP30301 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIPP30301 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIPP30301 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIPP30301 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIPP30301 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIPP30301 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIPP30301 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIPP30301 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIPP30301 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms