Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBMS1P29558 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms