Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD1P29536 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD1P29536 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms