Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINB3P29508 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINB3P29508 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINB3P29508 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms