Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA3P29320 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms