Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
DNMT1P26358 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DNMT1P26358 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DNMT1P26358 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
DNMT1P26358 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms