Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIAP25963 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms