Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA1P25391 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms