Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNCP24863 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNCP24863 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNCP24863 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNCP24863 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNCP24863 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNCP24863 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNCP24863 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNCP24863 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNCP24863 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNCP24863 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNCP24863 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNCP24863 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNCP24863 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNCP24863 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNCP24863 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNCP24863 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNCP24863 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNCP24863 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNCP24863 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNCP24863 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms