Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF4BP23588 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4BP23588 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms