Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KB1P23443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms