Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms