Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN1P20061 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN1P20061 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN1P20061 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN1P20061 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN1P20061 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN1P20061 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN1P20061 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN1P20061 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCN1P20061 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCN1P20061 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCN1P20061 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms