Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC3P19447 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC3P19447 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC3P19447 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms