Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCLP19338 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCLP19338 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCLP19338 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCLP19338 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCLP19338 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCLP19338 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCLP19338 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCLP19338 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCLP19338 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCLP19338 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCLP19338 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCLP19338 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCLP19338 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCLP19338 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCLP19338 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCLP19338 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCLP19338 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCLP19338 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCLP19338 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCLP19338 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCLP19338 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCLP19338 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCLP19338 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCLP19338 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms