Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCAM1P19320 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms