Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LBPP18428 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LBPP18428 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LBPP18428 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LBPP18428 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LBPP18428 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LBPP18428 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LBPP18428 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LBPP18428 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBPP18428 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBPP18428 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBPP18428 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LBPP18428 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBPP18428 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBPP18428 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms