Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP1P17987 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCP1P17987 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCP1P17987 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCP1P17987 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCP1P17987 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCP1P17987 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCP1P17987 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCP1P17987 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCP1P17987 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCP1P17987 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCP1P17987 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms