Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEBPBP17676 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEBPBP17676 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEBPBP17676 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms