Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF4P15884 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF4P15884 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF4P15884 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF4P15884 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF4P15884 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF4P15884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF4P15884 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF4P15884 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF4P15884 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF4P15884 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF4P15884 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF4P15884 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF4P15884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF4P15884 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF4P15884 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF4P15884 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF4P15884 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF4P15884 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCF4P15884 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF4P15884 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF4P15884 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms