Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOLR1P15328 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOLR1P15328 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms