Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FDPSP14324 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FDPSP14324 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FDPSP14324 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FDPSP14324 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FDPSP14324 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDPSP14324 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FDPSP14324 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FDPSP14324 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FDPSP14324 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDPSP14324 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FDPSP14324 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FDPSP14324 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FDPSP14324 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FDPSP14324 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FDPSP14324 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDPSP14324 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDPSP14324 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms