Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFAPP14136 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFAPP14136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFAPP14136 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFAPP14136 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFAPP14136 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFAPP14136 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFAPP14136 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFAPP14136 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFAPP14136 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFAPP14136 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFAPP14136 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFAPP14136 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFAPP14136 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFAPP14136 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFAPP14136 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GFAPP14136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFAPP14136 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFAPP14136 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFAPP14136 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFAPP14136 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFAPP14136 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFAPP14136 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFAPP14136 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFAPP14136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms