Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A3P13637 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP1A3P13637 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A3P13637 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms